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休斯顿大学的研究人员正在努力使 T 细胞免疫疗法更安全,他们开发了一种名为 CrossDome 的工具,该工具结合遗传和生化信息来预测 T 细胞免疫疗法是否会错误地攻击健康细胞。
基于 T 细胞的免疫疗法在抗击癌症和传染病方面具有巨大的潜力,这要归功于它们能够特异性靶向病变细胞,包括癌症转移。然而,这种潜力已因安全问题而有所缓和,即可能识别健康细胞显示的未知脱靶。
在一个案例中,科学家们创造了特殊的 T 细胞,这些 T 细胞应该靶向一种在称为黑色素瘤的皮肤癌中发现的蛋白质。然而,这些 T 细胞最终也攻击了一些患者心脏细胞中发现的另一种蛋白质。这对心脏造成了严重的伤害。
“我们的 CrossDome 工具有助于预测基于 T 细胞的免疫疗法的潜在风险。它结合使用不同类型的信息(称为多组学)来进行预测并确定治疗除了针对预期的患病细胞,”计算生物学助理教授、核受体和细胞信号传导中心成员 Dinler Antunes 说。他的工作发表在Frontiers in Immunology上。
“通过分析各种因素,CrossDome 提供了对基于 T 细胞的免疫疗法安全性的见解,并可能帮助研究人员开发更安全的治疗方法。”
为了测试 CrossDome 的有效性,Antunes 和 Altunes 实验室的博士后研究员 Andre F. Fonseca 用它来预测 16 个著名的 T 细胞交叉反应案例中的潜在错误,包括黑色素瘤-心脏损伤案例。该工具成功地将心脏蛋白识别为 T 细胞的潜在目标,将其列为数千种其他蛋白质中的高风险候选者。
为了加强结果,Antunes 结合了来自不同功能数据集的信息,以帮助评估某些基因的表达量以及它们与称为 HLA 的特定分子结合以触发免疫反应的可能性。
“这些信息帮助我们决定哪些潜在的脱靶基因值得在实验中进行测试,”Antunes 说。